40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5201 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  78.16 
 
 
92 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  52.11 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  52.11 
 
 
93 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  60.38 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  49.32 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  49.32 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  50.72 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  49.28 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  43.06 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  49.25 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  46.38 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  49.25 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  47.83 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  50.98 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4408  hypothetical protein  60 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0784  hypothetical protein  54.9 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1265  hypothetical protein  54.9 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  52.94 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  48.84 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  52 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  52 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  52 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  52 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  52 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  52 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1237  hypothetical protein  57.5 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241771  normal  0.149747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  38.81 
 
 
90 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  42.55 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  40.3 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  36.76 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  34.57 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1187  hypothetical protein  42.11 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  41.3 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5697  hypothetical protein  31.46 
 
 
102 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  40.38 
 
 
91 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  45.61 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  45.61 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3685  hypothetical protein  36.54 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649687  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4678  hypothetical protein  36.54 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>