33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3685 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4678  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353223  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3685  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649687  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  96.7 
 
 
91 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  94.51 
 
 
91 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  84.44 
 
 
91 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  49.43 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  45.35 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  49.43 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  45.78 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  45.78 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  44.19 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  46.75 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  44.58 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  42.22 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  53.66 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  42.5 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  45.59 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  40.98 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  40.98 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  46.81 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  40.32 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  42.31 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  38.24 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  37.5 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  32.05 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>