73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_AR0022 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_AR0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0795  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2627  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3071  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0028  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2985  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3037  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1985  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1566  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0054  tRNA-Ser  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0044  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  83.72 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0008  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0052  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0050  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0468  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0001  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309331  unclonable  0.0000000000000213015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0042  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0936822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0015  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.926323  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3054  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01508  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341382  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  81.4 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  81.4 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0037  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.182504  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  81.4 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0039  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2643  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  81.4 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0851644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0810  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0309716  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0034  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0046  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52557  normal  0.0292878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0059  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>