271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4843 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4843  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 76 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0098878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  40.28 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  42.11 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.92 
 
 		 641 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.32 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.9 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.46 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1851  rubredoxin  47.46 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  45.1 
 
 		 461 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.27 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  47.27 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  37.7 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  46.3 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50 
 
 		 589 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  46.3 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.62 
 
 		 445 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  46.3 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  44.44 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.68 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.76 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  47.27 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  47.27 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 		 480 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.76 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  40.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  40.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  40.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  40.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 444 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  44.44 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 455 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 415 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  43.86 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 		 235 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  43.86 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.46 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  39.68 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  46.94 
 
 		 55 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  46.94 
 
 		 55 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  40 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  42 
 
 		 477 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.88 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  46.81 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.88 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.68 
 
 		 58 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  35.19 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  46.67 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  48.89 
 
 		 56 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  40.43 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1240  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 444 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  42.86 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.11 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  47.83 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  37.04 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  44.9 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.62 
 
 		 469 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  44.9 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>