26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7456 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7456  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23419  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
192 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 
193 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
192 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  37.84 
 
 
236 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  37.16 
 
 
190 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  37.84 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  37.84 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  37.84 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  37.84 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  37.84 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  37.84 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  37.84 
 
 
236 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 
190 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  35.81 
 
 
191 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  35.81 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.11 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.11 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.11 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 
191 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>