83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1620 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1620  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607056  hitchhiker  0.0080305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1645  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1165  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1542  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  95.7 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1563  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  95.34 
 
 		 279 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220322  normal  0.220809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4791  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like  94.62 
 
 		 279 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1593  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  93.55 
 
 		 279 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0255002  normal  0.0108348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4076  hypothetical protein  65.81 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2863  pyoverdine synthetase F  67.15 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0528  hypothetical protein  65.44 
 
 		 280 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1621  hypothetical protein  68.01 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0284  hypothetical protein  68.01 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0062156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0877  hypothetical protein  68.01 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1177  hypothetical protein  68.01 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0387896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2092  pyoverdine synthetase F  68.01 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1931  hypothetical protein  68.01 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1946  hypothetical protein  68.01 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3738  hypothetical protein  64.23 
 
 		 281 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33700  pyoverdine synthetase F  65.69 
 
 		 275 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000013603  normal  0.0104807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4745  hypothetical protein  65.07 
 
 		 284 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953809  normal  0.245433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3726  hypothetical protein  63.8 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.76709  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2414  hypothetical protein  66.67 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00121568  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.65 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0028  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.67 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.73 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.81 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.5 
 
 		 189 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.55 
 
 		 195 aa  49.7  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.33 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.32 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.33 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.03 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.19 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.19 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.58 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.243956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.58 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.17 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000104232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.14 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.17 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.57 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.4 
 
 		 197 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.06 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.27 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  30.61 
 
 		 828 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.22 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.83 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.11 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.4 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  23.81 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.39 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.36 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.03 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.39 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.39 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.06 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.39 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.18 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.36 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.43 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.2 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.19 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.12 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.68 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.34 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.95 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.46 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.69 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1523  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.69 
 
 		 202 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0925  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.19 
 
 		 535 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000561233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.03 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.69 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.98 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.97 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.87 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.17 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.36 
 
 		 202 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.22 
 
 		 195 aa  42  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.92 
 
 		 208 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>