39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4076 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0528  hypothetical protein  95 
 
 		 280 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1177  hypothetical protein  82.37 
 
 		 279 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0387896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2092  pyoverdine synthetase F  82.37 
 
 		 279 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0877  hypothetical protein  82.37 
 
 		 279 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1946  hypothetical protein  82.37 
 
 		 279 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1621  hypothetical protein  82.37 
 
 		 279 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0284  hypothetical protein  82.37 
 
 		 279 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0062156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1931  hypothetical protein  82.37 
 
 		 279 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2414  hypothetical protein  82.11 
 
 		 247 aa  417  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00121568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33700  pyoverdine synthetase F  75.37 
 
 		 275 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000013603  normal  0.0104807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2863  pyoverdine synthetase F  70.22 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4745  hypothetical protein  70.22 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953809  normal  0.245433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3738  hypothetical protein  68.25 
 
 		 281 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3726  hypothetical protein  63.6 
 
 		 313 aa  355  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.76709  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1620  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  65.81 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607056  hitchhiker  0.0080305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1645  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  65.81 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1165  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like  65.81 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4791  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like  65.07 
 
 		 279 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1542  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  65.44 
 
 		 279 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1593  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  65.81 
 
 		 279 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0255002  normal  0.0108348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1563  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  65.07 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220322  normal  0.220809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.04 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.92 
 
 		 188 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.92 
 
 		 188 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.14 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0028  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.19 
 
 		 182 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.29 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.75 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.41 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.24 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.17 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.4 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.45 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.5 
 
 		 203 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.867032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.16 
 
 		 207 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.42 
 
 		 189 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>