27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2863 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2863  pyoverdine synthetase F  100 
 
 
275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33700  pyoverdine synthetase F  87.23 
 
 
275 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000013603  normal  0.0104807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0528  hypothetical protein  71.32 
 
 
280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918647  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2092  pyoverdine synthetase F  71.64 
 
 
279 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0877  hypothetical protein  71.64 
 
 
279 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1946  hypothetical protein  71.64 
 
 
279 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1931  hypothetical protein  71.64 
 
 
279 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0284  hypothetical protein  71.64 
 
 
279 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0062156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1621  hypothetical protein  71.64 
 
 
279 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1177  hypothetical protein  71.64 
 
 
279 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0387896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4076  hypothetical protein  70.22 
 
 
280 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3738  hypothetical protein  65.33 
 
 
281 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4745  hypothetical protein  68.01 
 
 
284 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953809  normal  0.245433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2414  hypothetical protein  70.37 
 
 
247 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00121568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3726  hypothetical protein  62.5 
 
 
313 aa  349  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.76709  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1165  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like  67.15 
 
 
279 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1620  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  67.15 
 
 
279 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607056  hitchhiker  0.0080305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1645  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  67.15 
 
 
279 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1542  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  66.42 
 
 
279 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1593  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  66.79 
 
 
279 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0255002  normal  0.0108348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1563  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like protein  66.06 
 
 
279 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220322  normal  0.220809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4791  folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN-like  65.33 
 
 
279 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.56 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.5 
 
 
189 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.57 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.21 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.92 
 
 
190 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>