55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5991 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  97.65 
 
 
213 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  92.96 
 
 
213 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  92.02 
 
 
213 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  92.96 
 
 
213 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  92.02 
 
 
213 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  82.46 
 
 
211 aa  367  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  89.42 
 
 
189 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  79.15 
 
 
213 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  77.93 
 
 
213 aa  353  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  76.3 
 
 
213 aa  349  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  76.3 
 
 
213 aa  337  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  78.43 
 
 
212 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  71.57 
 
 
225 aa  307  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  67.94 
 
 
212 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  65.88 
 
 
229 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  63.21 
 
 
223 aa  277  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  62.56 
 
 
231 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  57.82 
 
 
216 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  60.95 
 
 
214 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  54.72 
 
 
214 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  55.29 
 
 
219 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  57.43 
 
 
230 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  57.43 
 
 
218 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  54.29 
 
 
219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  54.81 
 
 
219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  49.76 
 
 
213 aa  235  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  48.82 
 
 
213 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  48.31 
 
 
231 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  49.29 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  50.48 
 
 
216 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  48.79 
 
 
257 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  45.02 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  48.22 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  48.22 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  43.37 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
224 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
224 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  32.67 
 
 
207 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2699  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8034  hypothetical protein  26.7 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1923  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  29.32 
 
 
239 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  47.92 
 
 
462 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06421  urea hydro-lyase/cyanamide hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10870)  32.32 
 
 
303 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.795012  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87356  predicted protein  24.44 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>