51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5607 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  97.31 
 
 
223 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  78.03 
 
 
224 aa  304  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  78.48 
 
 
224 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  78.48 
 
 
224 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  60 
 
 
220 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  47.37 
 
 
213 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  42.92 
 
 
213 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  42.58 
 
 
213 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 
212 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  41.63 
 
 
213 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
213 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 
219 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
213 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
219 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
219 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
213 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
214 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
216 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
257 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
213 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
213 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
213 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
213 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
212 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
230 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
213 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
225 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
189 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
238 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  30.24 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  26.61 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  32.61 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  45.61 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>