51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5824 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  97.31 
 
 
223 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  78.48 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  78.48 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  78.03 
 
 
224 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  59.05 
 
 
220 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  46.41 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  42.58 
 
 
213 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  41.51 
 
 
213 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  41.15 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  36.19 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  37.38 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
213 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
213 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
214 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 
219 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
231 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
257 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
211 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 
213 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 
216 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
219 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
213 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
213 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
213 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
213 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
213 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
213 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
213 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
225 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
189 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  25.14 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  46.3 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  31.88 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>