55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6387 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  97.71 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  81.74 
 
 		 219 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  81.28 
 
 		 219 aa  370  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  79.45 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  68.81 
 
 		 216 aa  295  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  67.33 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  57.92 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  57.97 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  58.91 
 
 		 213 aa  248  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  57.14 
 
 		 213 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  57.43 
 
 		 213 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  56.16 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  55.71 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  56.44 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  55.17 
 
 		 213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  55.17 
 
 		 213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  57.28 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  54.68 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  55.67 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  54.95 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  54.41 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  54.81 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  55.34 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  53.47 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  60.34 
 
 		 189 aa  228  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  54.46 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  51.98 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  48.51 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  48.77 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  54 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  54 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  49.01 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8034  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2699  hypothetical protein  33.77 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  33.08 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06421  urea hydro-lyase/cyanamide hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10870)  28.48 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.795012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1329  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0394567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3136  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>