53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0179 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
213 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
216 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  41.06 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
214 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 
213 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 
213 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
213 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  37.38 
 
 
212 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  39.05 
 
 
213 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
213 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
214 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
213 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  37.69 
 
 
219 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 
189 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  37.69 
 
 
231 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 
219 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  37.69 
 
 
219 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  34.47 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  37.43 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
213 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  31.86 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
216 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
231 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2699  hypothetical protein  32.02 
 
 
209 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
223 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
223 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  43.66 
 
 
238 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8034  hypothetical protein  31.9 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1923  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  32.5 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06421  urea hydro-lyase/cyanamide hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10870)  25.26 
 
 
303 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.795012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>