55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1089 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2699  hypothetical protein  54.55 
 
 
209 aa  238  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  53.11 
 
 
209 aa  230  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 
229 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
213 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
210 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 
213 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
213 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 
213 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
214 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
211 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
213 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 
212 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
213 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
214 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  30.64 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 
231 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
257 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
213 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  28.05 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8034  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1923  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06421  urea hydro-lyase/cyanamide hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10870)  26.46 
 
 
303 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.795012  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87356  predicted protein  21.43 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  24.56 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  24.56 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 
223 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 
224 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05411  cyanamide hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06270)  27.41 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.242482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>