53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2386 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  77.46 
 
 
213 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  74.65 
 
 
213 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  59.52 
 
 
212 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  58.77 
 
 
231 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  56.4 
 
 
229 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  50.96 
 
 
214 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  49.76 
 
 
213 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  49.77 
 
 
213 aa  234  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  48.82 
 
 
213 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6387  metal-dependent phosphohydrolase  53.47 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0718177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  50.23 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  50.24 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  49.29 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  48.82 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6986  metal dependent phosphohydrolase  51.67 
 
 
219 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6090  metal dependent phosphohydrolase  51.98 
 
 
230 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  48.82 
 
 
213 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  51.18 
 
 
223 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  49.29 
 
 
213 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  49.29 
 
 
213 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6136  metal-dependent phosphohydrolase  51.69 
 
 
219 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.585669  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  48.82 
 
 
213 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  50.24 
 
 
213 aa  228  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
211 aa  228  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  50.74 
 
 
225 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  50.24 
 
 
219 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  50.5 
 
 
212 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  51.32 
 
 
189 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  47.14 
 
 
214 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6131  metal-dependent phosphohydrolase  49.76 
 
 
231 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 
220 aa  204  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3555  metal dependent phosphohydrolase  48.78 
 
 
257 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6763  metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1408  metal dependent phosphohydrolase  43.66 
 
 
212 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1390  metal dependent phosphohydrolase  43.66 
 
 
212 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  42.58 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  42.58 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
224 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5740  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1087  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
213 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0179  metal dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475429  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0912  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
213 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0929  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
213 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0919  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1089  hypothetical protein  30.64 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2700  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
209 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2699  hypothetical protein  32.94 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  60.34 
 
 
462 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8034  hypothetical protein  28.5 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1923  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2314  hypothetical protein  36.14 
 
 
239 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>