53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1988 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  913    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0600  hypothetical protein  99.68 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0691  hypothetical protein  99.03 
 
 
308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2384  hypothetical protein  67.43 
 
 
319 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166894  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6128  hypothetical protein  68.85 
 
 
316 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5726  hypothetical protein  67.62 
 
 
311 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0189  hypothetical protein  62.99 
 
 
299 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5831  hypothetical protein  57.88 
 
 
319 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5614  hypothetical protein  57.88 
 
 
309 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.073434  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0916  hypothetical protein  58.88 
 
 
304 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1398  hypothetical protein  58.88 
 
 
304 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1376  hypothetical protein  58.55 
 
 
304 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336198  normal  0.106671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4541  hypothetical protein  57.24 
 
 
304 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1484  hypothetical protein  63.6 
 
 
317 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.952344  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7011  hypothetical protein  63.6 
 
 
317 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0351796 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6345  hypothetical protein  63.6 
 
 
317 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1275  hypothetical protein  61.98 
 
 
304 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1309  hypothetical protein  61.22 
 
 
304 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.351761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2394  hypothetical protein  59.4 
 
 
306 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5592  hypothetical protein  63.12 
 
 
296 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3143  hypothetical protein  63.85 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5708  metal-dependent phosphohydrolase  44.14 
 
 
213 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.138943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2386  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6130  hypothetical protein  56.9 
 
 
213 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4971  metal-dependent phosphohydrolase  39.73 
 
 
213 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0687191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5723  metal-dependent phosphohydrolase  47.27 
 
 
220 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1881  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
213 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5991  metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 
213 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5400  metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 
223 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.934439  hitchhiker  0.00141947 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7018  metal-dependent phosphohydrolase  47.37 
 
 
224 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497527  normal  0.0702761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6613  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
213 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5747  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
213 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  0.753419 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5735  metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 
214 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952671  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1480  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
225 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6352  metal-dependent phosphohydrolase  45.61 
 
 
224 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121417  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6210  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
213 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1476  metal-dependent phosphohydrolase  45.61 
 
 
224 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0767575  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5843  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
213 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3128  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
213 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2288  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3003  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214895  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5824  metal-dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
223 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5607  metal-dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 
223 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18417  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4196  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
229 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1676  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
211 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.861331  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6686  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
213 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5631  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
216 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2024  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1146  metal-dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
213 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194761  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5147  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
213 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3226  metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 
214 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806611  normal  0.434308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5331  metal dependent phosphohydrolase  46.34 
 
 
189 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.763735  normal  0.0410996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3551  metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
219 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  0.924756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>