21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1275 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1309  hypothetical protein  97.7 
 
 		 304 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.351761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4541  hypothetical protein  88.49 
 
 		 304 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1376  hypothetical protein  90.79 
 
 		 304 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336198  normal  0.106671 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1398  hypothetical protein  90.46 
 
 		 304 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0916  hypothetical protein  90.46 
 
 		 304 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5831  hypothetical protein  81.52 
 
 		 319 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5614  hypothetical protein  81.52 
 
 		 309 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.073434  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1484  hypothetical protein  86.74 
 
 		 317 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.952344  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6345  hypothetical protein  86.74 
 
 		 317 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7011  hypothetical protein  86.74 
 
 		 317 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0351796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0189  hypothetical protein  75.83 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5592  hypothetical protein  71.59 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2384  hypothetical protein  58.28 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2394  hypothetical protein  65.28 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5726  hypothetical protein  61.33 
 
 		 311 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3143  hypothetical protein  69.7 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6128  hypothetical protein  58.61 
 
 		 316 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0691  hypothetical protein  62.84 
 
 		 308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  61.98 
 
 		 462 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0600  hypothetical protein  61.98 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>