21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6128 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6128  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2384  hypothetical protein  86.71 
 
 
319 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166894  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  72.93 
 
 
462 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5726  hypothetical protein  74.81 
 
 
311 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0600  hypothetical protein  72.93 
 
 
308 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0691  hypothetical protein  72.35 
 
 
308 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0189  hypothetical protein  63.77 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5831  hypothetical protein  63.57 
 
 
319 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5614  hypothetical protein  63.57 
 
 
309 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.073434  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0916  hypothetical protein  63.85 
 
 
304 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1398  hypothetical protein  63.85 
 
 
304 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1275  hypothetical protein  62.74 
 
 
304 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4541  hypothetical protein  62.74 
 
 
304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7011  hypothetical protein  62.45 
 
 
317 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0351796 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6345  hypothetical protein  62.45 
 
 
317 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389879  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1484  hypothetical protein  62.45 
 
 
317 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.952344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1376  hypothetical protein  63.08 
 
 
304 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336198  normal  0.106671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1309  hypothetical protein  61.98 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.351761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2394  hypothetical protein  59.47 
 
 
306 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5592  hypothetical protein  60.84 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3143  hypothetical protein  60.85 
 
 
312 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>