21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1309 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1309  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.351761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1275  hypothetical protein  97.7 
 
 
304 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4541  hypothetical protein  87.83 
 
 
304 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1376  hypothetical protein  90.79 
 
 
304 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336198  normal  0.106671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0916  hypothetical protein  89.8 
 
 
304 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1398  hypothetical protein  89.8 
 
 
304 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5831  hypothetical protein  81.52 
 
 
319 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5614  hypothetical protein  81.52 
 
 
309 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.073434  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1484  hypothetical protein  86.36 
 
 
317 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.952344  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6345  hypothetical protein  86.36 
 
 
317 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389879  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7011  hypothetical protein  86.36 
 
 
317 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0351796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0189  hypothetical protein  75.17 
 
 
299 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5592  hypothetical protein  71.21 
 
 
296 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2384  hypothetical protein  57.95 
 
 
319 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166894  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5726  hypothetical protein  61.79 
 
 
311 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3143  hypothetical protein  69.7 
 
 
312 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2394  hypothetical protein  64.15 
 
 
306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6128  hypothetical protein  57.95 
 
 
316 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0691  hypothetical protein  62.07 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1988  hypothetical protein  61.22 
 
 
462 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0600  hypothetical protein  61.22 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>