More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4883 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4883  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 344 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000348291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3432  rod shape-determining protein MreB  94.48 
 
 		 344 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5352  rod shape-determining protein MreB  94.48 
 
 		 344 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00418366  normal  0.0848923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4366  rod shape-determining protein MreB  99.13 
 
 		 344 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313283 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4936  rod shape-determining protein MreB  94.48 
 
 		 344 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0756  rod shape-determining protein MreB  91.91 
 
 		 346 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421254  hitchhiker  0.00154989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3685  rod shape-determining protein MreB  87.65 
 
 		 344 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0187994  normal  0.447669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1780  rod shape-determining protein MreB  73.59 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0942  rod shape-determining protein MreB  74.18 
 
 		 382 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0819  rod shape-determining protein MreB  74.18 
 
 		 354 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1586  rod shape-determining protein MreB  74.18 
 
 		 354 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2194  rod shape-determining protein MreB  74.18 
 
 		 382 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00417366  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0035  rod shape-determining protein MreB  74.18 
 
 		 382 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0180616  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0849  rod shape-determining protein MreB  74.18 
 
 		 354 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5528  rod shape-determining protein MreB  64.16 
 
 		 350 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919576  normal  0.53054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1131  rod shape-determining protein MreB  65.34 
 
 		 350 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5202  rod shape-determining protein MreB  62.95 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 347 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 347 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 347 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 347 aa  331  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5235  rod shape-determining protein MreB  51.63 
 
 		 347 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.979505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 352 aa  328  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 		 349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  51.8 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  51.95 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1376  rod shape-determining protein MreB  51.63 
 
 		 347 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0877019  normal  0.0232358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0083  rod shape-determining protein MreB  51.66 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.400729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1738  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.863773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  52.12 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  50.46 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  51.46 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0283  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 347 aa  319  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 347 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  51.04 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  51.04 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 		 346 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  318  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  318  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.81 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>