More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5202 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5202  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 351 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5528  rod shape-determining protein MreB  76.59 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919576  normal  0.53054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1131  rod shape-determining protein MreB  77.75 
 
 		 350 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0819  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 354 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0849  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 354 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1586  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 354 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2194  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 382 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00417366  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0035  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 382 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0180616  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1780  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0942  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 382 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5352  rod shape-determining protein MreB  64.26 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00418366  normal  0.0848923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3432  rod shape-determining protein MreB  64.26 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4936  rod shape-determining protein MreB  64.26 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0756  rod shape-determining protein MreB  64.37 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421254  hitchhiker  0.00154989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3685  rod shape-determining protein MreB  64.46 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0187994  normal  0.447669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4883  rod shape-determining protein MreB  62.95 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000348291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4366  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313283 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 347 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  55.02 
 
 		 347 aa  355  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  54.41 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  54.1 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0283  rod shape-determining protein MreB  54.41 
 
 		 347 aa  351  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1376  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0877019  normal  0.0232358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 		 347 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5235  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 347 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.979505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0083  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.400729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1738  rod shape-determining protein MreB  52.42 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.863773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0173  rod shape-determining protein MreB  55.02 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  51.95 
 
 		 352 aa  345  8e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  52.42 
 
 		 347 aa  345  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0233  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1610  rod shape-determining protein MreB  55.62 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123336  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0239  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.944455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0294  rod shape-determining protein MreB  54.41 
 
 		 347 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 349 aa  342  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  51.84 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 		 347 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  51.66 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  51.61 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  51.61 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  50.73 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4561  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  50.31 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>