More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5528 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5528  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 350 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919576  normal  0.53054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1131  rod shape-determining protein MreB  92.86 
 
 		 350 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5202  rod shape-determining protein MreB  76.59 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1586  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0819  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2194  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 382 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00417366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0942  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 382 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1780  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0849  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0035  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 382 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0180616  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5352  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00418366  normal  0.0848923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3432  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4936  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0756  rod shape-determining protein MreB  65.17 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421254  hitchhiker  0.00154989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3685  rod shape-determining protein MreB  64.65 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0187994  normal  0.447669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4366  rod shape-determining protein MreB  64.76 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4883  rod shape-determining protein MreB  64.16 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000348291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  56.53 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  55.02 
 
 		 347 aa  351  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0283  rod shape-determining protein MreB  55.93 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  54.24 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 347 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1376  rod shape-determining protein MreB  56 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0877019  normal  0.0232358 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  53.96 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 347 aa  345  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0083  rod shape-determining protein MreB  54.13 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.400729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0233  rod shape-determining protein MreB  55.93 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0239  rod shape-determining protein MreB  55.93 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.944455 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  53.85 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0294  rod shape-determining protein MreB  55.93 
 
 		 347 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5235  rod shape-determining protein MreB  55.38 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.979505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0173  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1738  rod shape-determining protein MreB  52.71 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.863773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  53.01 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  52.41 
 
 		 347 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1610  rod shape-determining protein MreB  56.53 
 
 		 347 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123336  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 		 347 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  51.95 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  51.5 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  51.5 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  51.35 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 347 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 		 349 aa  335  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  53.55 
 
 		 347 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  52 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  52 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  51.36 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  51.05 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>