More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0116 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 347 aa  693    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  85.01 
 
 		 347 aa  607  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  85.59 
 
 		 347 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  85.3 
 
 		 347 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  85.3 
 
 		 347 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  85.3 
 
 		 347 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  85.01 
 
 		 347 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  83.86 
 
 		 347 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  83.29 
 
 		 347 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  83.86 
 
 		 347 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0083  rod shape-determining protein MreB  82.71 
 
 		 347 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.400729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  81.84 
 
 		 347 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1738  rod shape-determining protein MreB  81.84 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.863773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  82.27 
 
 		 349 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  80.98 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  80.4 
 
 		 347 aa  544  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0283  rod shape-determining protein MreB  80.69 
 
 		 347 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2491  rod shape-determining protein MreB  81.27 
 
 		 347 aa  541  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00448666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5235  rod shape-determining protein MreB  78.96 
 
 		 347 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.979505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1376  rod shape-determining protein MreB  78.96 
 
 		 347 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0877019  normal  0.0232358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  77.27 
 
 		 352 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0233  rod shape-determining protein MreB  80.12 
 
 		 347 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1610  rod shape-determining protein MreB  80.12 
 
 		 347 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123336  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0239  rod shape-determining protein MreB  79.83 
 
 		 347 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.944455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0173  rod shape-determining protein MreB  79.25 
 
 		 362 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0294  rod shape-determining protein MreB  79.25 
 
 		 347 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  70.89 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  71.18 
 
 		 349 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  70.03 
 
 		 349 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  68.68 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  71.72 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  68.97 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  69.74 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  70.12 
 
 		 345 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  69.74 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  69.74 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  70.2 
 
 		 347 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  70.69 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  70.5 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  70.09 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  70.8 
 
 		 345 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  69.63 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  70.21 
 
 		 345 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  69.91 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  69.16 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  70.8 
 
 		 345 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  70.8 
 
 		 345 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  70.5 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  70.5 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  70.5 
 
 		 345 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  69.63 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  70.55 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  70.5 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  70.5 
 
 		 345 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  69.63 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  70.32 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  70.32 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  70.67 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  71.47 
 
 		 349 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  71.47 
 
 		 349 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  70.89 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  69.19 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  71.18 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  71.18 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  69.03 
 
 		 345 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  71.18 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  70.89 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  70.89 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  70.89 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>