More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4847 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6794  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 131 aa  216  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4847  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 114 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.526287  normal  0.040677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4292  small multidrug resistance protein  89.47 
 
 		 114 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  43.81 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  41.18 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.63 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  44.66 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  40.38 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  43.56 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  45.63 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 105 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  42.72 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38.53 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38.53 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  39.22 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000273  molecular chaperone SugE  46.08 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.83 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  35.4 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.19 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  45.63 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  42.31 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>