107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0130 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0130  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  100 
 
 
269 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0120  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  96.65 
 
 
264 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2925  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  94.78 
 
 
265 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.529994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0130  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  94.78 
 
 
265 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0144  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  94.78 
 
 
265 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3310  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  88.15 
 
 
264 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0128  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  85.82 
 
 
268 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.971788  normal  0.684613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3281  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  85.61 
 
 
263 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0140  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  85.23 
 
 
267 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3938  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  85.23 
 
 
267 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4010  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  85.23 
 
 
267 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2984  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  84.85 
 
 
267 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3322  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  84.85 
 
 
267 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1554  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  84.85 
 
 
267 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3048  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  84.85 
 
 
267 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0008  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  75.58 
 
 
264 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0022  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  74.14 
 
 
265 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4443  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  74.42 
 
 
265 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5491  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  60.39 
 
 
266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2412  Ethanolamine ammonia-lyase  56.08 
 
 
274 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3435  ethanolamine ammonia-lyase  58.98 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5903  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  60.16 
 
 
256 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.542199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4033  ethanolamine ammonia-lyase  56.69 
 
 
258 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330675  normal  0.0407516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2683  ethanolamine ammonia-lyase light chain  56.92 
 
 
254 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125834  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4308  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  58.66 
 
 
263 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4418  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  58.66 
 
 
263 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2627  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  53.76 
 
 
286 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358649  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11760  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  52.81 
 
 
273 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4992  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  53.7 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1081  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  51.69 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09930  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  56.03 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0277  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  50.58 
 
 
278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1428  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  52.27 
 
 
302 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0627  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  52.55 
 
 
282 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0726  ethanolamine ammonia-lyase, light subunit  53.17 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3126  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  54.47 
 
 
270 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3530  ethanolamine ammonia-lyase  53.56 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  0.426179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1383  Ethanolamine ammonia-lyase light chain  57.71 
 
 
256 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1072  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  50.59 
 
 
253 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2418  ethanolamine ammonia-lyase light chain  54.8 
 
 
264 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278269  normal  0.98015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0587  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  52.42 
 
 
272 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.322451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0542  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  52.42 
 
 
272 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0581  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  52.42 
 
 
272 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0594  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  51.81 
 
 
272 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2802  ethanolamine ammonia-lyase  53.1 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0476  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  51.18 
 
 
284 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000713  ethanolamine ammonia-lyase light chain  46.56 
 
 
294 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.384186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0587  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  53.15 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2259  ethanolamine ammonia-lyase  50.78 
 
 
257 aa  235  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3277  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  57.03 
 
 
261 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1953  ethanolamine ammonia-lyase  56.13 
 
 
264 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0270526  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2765  Ethanolamine ammonia-lyase  48.02 
 
 
260 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2229  Ethanolamine ammonia-lyase  54.94 
 
 
264 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2942  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  50.97 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.574603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0848  ethanolamine ammonia-lyase  58.23 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1908  Ethanolamine ammonia-lyase  55.82 
 
 
260 aa  214  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.903104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1784  Ethanolamine ammonia-lyase  46.72 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8501  Ethanolamine ammonia-lyase light chain  49.21 
 
 
267 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2982  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  51.16 
 
 
271 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4268  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  50.19 
 
 
255 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.738679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2926  Ethanolamine ammonia-lyase  48.59 
 
 
272 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1381  Ethanolamine ammonia-lyase  44.06 
 
 
262 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244337  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3630  Ethanolamine ammonia-lyase  52.24 
 
 
251 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.682386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3052  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  41.83 
 
 
245 aa  199  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.286681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1252  Ethanolamine ammonia-lyase  47.06 
 
 
280 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000361416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2365  Ethanolamine ammonia-lyase  48.41 
 
 
245 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2263  ethanolamine ammonia-lyase light chain  49.17 
 
 
249 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4775  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  55.43 
 
 
291 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6288  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  44.88 
 
 
251 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1031  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  49.15 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0066  ethanolamine ammonia-lyase  47.78 
 
 
251 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3198  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  50 
 
 
250 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3738  ethanolamine ammonia-lyase light chain  46.53 
 
 
259 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1713  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  47.33 
 
 
262 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0666943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3313  ethanolamine ammonia-lyase  48.54 
 
 
261 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1719  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  47.95 
 
 
259 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.144644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2933  Ethanolamine ammonia-lyase  48.09 
 
 
256 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2576  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  44.17 
 
 
256 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21510  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  46.22 
 
 
280 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1846  Ethanolamine ammonia-lyase  46.48 
 
 
262 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4844  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  47.83 
 
 
263 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1055  Ethanolamine ammonia-lyase  36.73 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0892  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  29.67 
 
 
295 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2645  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  30.57 
 
 
296 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4860  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  33.19 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2595  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.97255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2650  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35.75 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2717  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35.75 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.953198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2691  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35.91 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.172588  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2602  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35.91 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2824  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35.75 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02340  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1241  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  32.77 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2577  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2726  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1239  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375205  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02302  hypothetical protein  35 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1221  Ethanolamine ammonia-lyase  35 
 
 
295 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3670  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  35 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1296  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  31.67 
 
 
312 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>