96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR_t17 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.099885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t17  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0956  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0199  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 66 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4319  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663542  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0069  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.299902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  92.11 
 
 		 141 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0106  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281433  hitchhiker  0.00000200758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0031  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390279  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156043  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 67 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0063  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0125  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000837111  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0012  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471876  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000252588  normal  0.0241581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>