147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_R0037 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.099885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0956  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t17  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.610036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4319  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663542  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0069  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.299902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0031  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390279  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  92.68 
 
 		 141 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0106  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281433  hitchhiker  0.00000200758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 67 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0199  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 66 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156043  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t007  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0014  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000252588  normal  0.0241581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0014  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000837111  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0014  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0012  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471876  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0125  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0063  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0012  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>