61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3142 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3142  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  100 
 
 
74 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2176  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2  100 
 
 
74 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0231032  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1911  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2  79.31 
 
 
181 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2560  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  79.31 
 
 
181 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2613  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  79.31 
 
 
181 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811182  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2693  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  79.31 
 
 
181 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1184  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2  77.59 
 
 
185 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0459024  hitchhiker  0.0000986969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1401  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2-like protein  77.59 
 
 
183 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  hitchhiker  0.00000441945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5396  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2-like  83.33 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128294  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2126  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2-like protein  77.59 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2000  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2-like protein  77.59 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132256  hitchhiker  0.00000111072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1615  putative fkbp-type peptidyl-prolyl cis- transisomerase (rotamase)  95.74 
 
 
179 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200826  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2522  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-transisomerase (rotamase)  95.74 
 
 
180 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000109696  hitchhiker  0.0000000030233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1087  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) protein  77.59 
 
 
175 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0991  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) protein  77.59 
 
 
174 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1149  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) protein  95.65 
 
 
174 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172977  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2109  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 2-like protein  93.62 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120756  normal  0.0231654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2090  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2-like protein  93.62 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1073  putative fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) protein  93.48 
 
 
186 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.962748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1109  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) protein  93.48 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0988  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  80 
 
 
203 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0436007  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0851  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  77.78 
 
 
207 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5987  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2-like  89.74 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1277  putative fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.36 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3968  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  71.11 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.0533414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4719  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  59.26 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5246  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  67.39 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00340129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0980  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.179739  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0836  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0875435  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2349  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  54.35 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0587  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.78 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0591341  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1190  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.11 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00107243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0669  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  49.12 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0486814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2294  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  48.89 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0579993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2351  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.49 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0904  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  54.17 
 
 
203 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211342  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0212  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0913  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  46.67 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195763  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0971  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) protein  46.67 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2907  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.15 
 
 
188 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.825142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1174  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  56.76 
 
 
209 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1065  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.76 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0180  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  40.32 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1269  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  56.76 
 
 
207 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0359  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  40.32 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0740624  normal  0.693438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2741  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  62.16 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.415739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2643  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.65 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4604  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.55 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752896  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3087  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.35 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00430084  hitchhiker  0.00349197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1226  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.35 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000383384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1303  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.35 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135786  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1270  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.35 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000605052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2736  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.35 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000704318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1208  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44.68 
 
 
224 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1137  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.35 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330885  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1138  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.35 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3417  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  51.35 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3314  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.55 
 
 
157 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2141  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  41.67 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3964  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.55 
 
 
157 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.120161  normal  0.2774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1078  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  40.74 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031845  normal  0.904135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>