122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0874 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0874  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00437397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1501  hypothetical protein  48.25 
 
 
133 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0425367  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  41.83 
 
 
176 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  38.99 
 
 
156 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  42.96 
 
 
146 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0862  protein of unknown function DUF985  41.33 
 
 
148 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0577579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  41.5 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  43.75 
 
 
286 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  40.41 
 
 
271 aa  97.1  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  39.44 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  39.04 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  40.56 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  40.41 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  37.06 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  38.73 
 
 
154 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  39.31 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  37.06 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  35.86 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  37.06 
 
 
140 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  38.51 
 
 
155 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  40.25 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  37.24 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  37.58 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  40.79 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  37.76 
 
 
148 aa  87  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  37.76 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  37.24 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  37.24 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  37.24 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  35.4 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  35.29 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  37.33 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  37.11 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  37.76 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  37.33 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  38.57 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  35.03 
 
 
172 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  37.09 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  37.58 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  34.64 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  33.57 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  35.62 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  37.58 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  37.5 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  34.64 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  33.54 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  33.78 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  34.67 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2150  hypothetical protein  34.94 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  33.78 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  35.22 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  35.53 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  31.37 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  32.05 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  34.03 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  33.78 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  34.03 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  33.56 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  36.11 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  36 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  34.72 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  34.03 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  31.45 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  35.95 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  32.65 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  33.99 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  31.94 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  36.55 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  32.5 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  31.91 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  31.08 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  29.14 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  34.04 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  34.04 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2039  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  27.63 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  34.01 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  30.52 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  33.79 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  27.56 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  34.01 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  36.84 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  34.93 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  29.17 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  32.91 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  32.47 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  32.65 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  30.07 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>