22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6539 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1149    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_004310  BR1620  hypothetical protein  28.36 
 
 		 585 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1563  hypothetical protein  28.17 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0641999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  25.67 
 
 		 627 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6538  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0396016  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  29.14 
 
 		 474 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0938  hypothetical protein  28.16 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0765  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2217  hypothetical protein  27.14 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2473  hypothetical protein  26.42 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3514  hypothetical protein  29.14 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2305  hypothetical protein  25.82 
 
 		 437 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3464  hypothetical protein  25.45 
 
 		 437 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38137  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2947  hypothetical protein  26.23 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  0.624545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2060  hypothetical protein  27.63 
 
 		 435 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0474  hypothetical protein  27.96 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.153651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  30.07 
 
 		 473 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  28.76 
 
 		 513 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  28.1 
 
 		 508 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  28.1 
 
 		 508 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  28.91 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  28.1 
 
 		 514 aa  47  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>