15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3514 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3514  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  876    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2473  hypothetical protein  57.04 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3464  hypothetical protein  57.35 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38137  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2305  hypothetical protein  56.87 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2217  hypothetical protein  55.26 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2947  hypothetical protein  57.04 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  0.624545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2060  hypothetical protein  53.83 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0474  hypothetical protein  43.53 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.153651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0765  hypothetical protein  41.78 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0938  hypothetical protein  31.96 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  27.69 
 
 		 627 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  29.26 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  28.9 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1563  hypothetical protein  24.88 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0641999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1620  hypothetical protein  24.88 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>