16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0938 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0938  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  944    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2217  hypothetical protein  37.65 
 
 
439 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3464  hypothetical protein  36.89 
 
 
437 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38137  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2947  hypothetical protein  35.96 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  0.624545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2305  hypothetical protein  36.43 
 
 
437 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2473  hypothetical protein  35.43 
 
 
437 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852078  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0765  hypothetical protein  35.65 
 
 
438 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3514  hypothetical protein  31.96 
 
 
436 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.666234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0474  hypothetical protein  31.34 
 
 
436 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.153651  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2060  hypothetical protein  29.02 
 
 
435 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522944  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  27.53 
 
 
627 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  26.29 
 
 
474 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1563  hypothetical protein  24.88 
 
 
585 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0641999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1620  hypothetical protein  24.88 
 
 
585 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  28.16 
 
 
571 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  27.09 
 
 
502 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>