15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3464 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3464  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  884    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38137  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2305  hypothetical protein  98.86 
 
 		 437 aa  875    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2473  hypothetical protein  95.42 
 
 		 437 aa  851    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2947  hypothetical protein  88.79 
 
 		 437 aa  782    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  0.624545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2217  hypothetical protein  60.86 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3514  hypothetical protein  57.52 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2060  hypothetical protein  47.29 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0474  hypothetical protein  46.19 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.153651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0765  hypothetical protein  46.12 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0938  hypothetical protein  36.89 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  29.27 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_004310  BR1620  hypothetical protein  27.49 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1563  hypothetical protein  27.49 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0641999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  26.47 
 
 		 627 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  25.45 
 
 		 571 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>