15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2217 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  898    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2305  hypothetical protein  61.34 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2473  hypothetical protein  60.05 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2947  hypothetical protein  60.57 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  0.624545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3464  hypothetical protein  60.86 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38137  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3514  hypothetical protein  55.26 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2060  hypothetical protein  48.62 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0474  hypothetical protein  44.22 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.153651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0765  hypothetical protein  44.21 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0938  hypothetical protein  37.65 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0568  hypothetical protein  26.65 
 
 		 627 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  30.36 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_004310  BR1620  hypothetical protein  27.68 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1563  hypothetical protein  27.68 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0641999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6539  hypothetical protein  27.14 
 
 		 571 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.360939  normal  0.381321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>