56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4980 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4980  putative transposase  100 
 
 		 133 aa  264  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.733834 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  39.44 
 
 		 242 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  38.18 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  44.68 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  44.68 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  35.71 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  31.15 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  31.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  38.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  38.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  34.44 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2165  ISBma4, transposase  36.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2249  ISBma4, transposase  36.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2532  ISBma4, transposase  36.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.409059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3042  ISBma4, transposase  36.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2631  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  40.48 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  29.52 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  40.48 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  40.48 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  40.48 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 92 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 		 97 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  34.94 
 
 		 118 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  34.94 
 
 		 118 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>