More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7167 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7167  sulfonate monooxygenase  100 
 
 
356 aa  724    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6403  Alkanesulfonate monooxygenase  76.06 
 
 
378 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0897657  normal  0.244212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4522  Alkanesulfonate monooxygenase  75.21 
 
 
356 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3778  Alkanesulfonate monooxygenase  66.29 
 
 
349 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0431  Luciferase-like monooxygenase  62.92 
 
 
352 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  36.21 
 
 
375 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  36.26 
 
 
364 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  37.23 
 
 
402 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  35.01 
 
 
379 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.29 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  35.39 
 
 
371 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.45 
 
 
381 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  36.01 
 
 
381 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  37.16 
 
 
377 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 
381 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 
381 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  35.25 
 
 
381 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  34.32 
 
 
371 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 
381 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 
381 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  34.32 
 
 
371 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  34.32 
 
 
371 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  34.73 
 
 
379 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  36.09 
 
 
405 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  32.98 
 
 
399 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  33.52 
 
 
396 aa  176  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  34.17 
 
 
391 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  35.01 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  36.84 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  34.97 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  34.97 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  36.04 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  33.06 
 
 
387 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3345  alkanesulfonate monooxygenase  35.13 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  34.97 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.33 
 
 
381 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  34.47 
 
 
360 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  33.06 
 
 
386 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  36.44 
 
 
360 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  32.77 
 
 
381 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
392 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
380 aa  169  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  34.44 
 
 
380 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  34.9 
 
 
387 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  34.17 
 
 
391 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  34.86 
 
 
382 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  35.25 
 
 
394 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  34.82 
 
 
395 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  34.15 
 
 
387 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  33.89 
 
 
380 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  34.93 
 
 
378 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  34.4 
 
 
389 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  34.4 
 
 
389 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  34.4 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  34.17 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
391 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  33.43 
 
 
382 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  32.87 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  32.35 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
387 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
381 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  32.69 
 
 
382 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  32.92 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  33.61 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  32.88 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2070  Alkanesulfonate monooxygenase  31.99 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  33.33 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  38.48 
 
 
360 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  36.22 
 
 
380 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  33.51 
 
 
417 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2314  alkanesulfonate monooxygenase  34.54 
 
 
370 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000473063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
382 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2929  alkanesulfonate monooxygenase  34.54 
 
 
370 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2963  alkanesulfonate monooxygenase  34.82 
 
 
370 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.382822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  33.15 
 
 
385 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  31.4 
 
 
389 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  33.74 
 
 
364 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2711  alkanesulfonate monooxygenase  34.26 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2639  alkanesulfonate monooxygenase  34.26 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.399312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  32.7 
 
 
385 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2919  alkanesulfonate monooxygenase  34.26 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  33.61 
 
 
384 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2958  alkanesulfonate monooxygenase  33.98 
 
 
370 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2662  alkanesulfonate monooxygenase  34.26 
 
 
370 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  33.88 
 
 
387 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  33.7 
 
 
391 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  32.08 
 
 
367 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  35.5 
 
 
382 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 
395 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  32.62 
 
 
385 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3814  luciferase-like protein  34.85 
 
 
400 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  33.54 
 
 
366 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  33.42 
 
 
382 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  33.13 
 
 
366 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  31.64 
 
 
367 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  33.42 
 
 
382 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  32.8 
 
 
395 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  33.61 
 
 
377 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>