More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5608 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5608  extragenic suppressor protein SuhB  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6169  Inositol-phosphate phosphatase  68.98 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684591 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6576  Inositol-phosphate phosphatase  68.86 
 
 		 277 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516449  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  42.51 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  42.23 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  39.23 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  41.11 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  38.4 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  40.4 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  43.36 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  38.46 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  39.16 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  39.16 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  39.16 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  39.16 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  38.4 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  38.4 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  40.62 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  38.26 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  38.02 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  37.69 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  38.02 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  40.23 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  43.42 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  39.06 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  41.85 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  39.53 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  41.15 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  39.53 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  39.47 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  40.16 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  40.32 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  39.63 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  39.92 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  38.28 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  39.04 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  40.39 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  39.04 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.57 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.82 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  39.04 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  39.02 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  36.92 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  42.34 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  36.92 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  36.92 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  42.19 
 
 		 431 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  36.92 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  36.92 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  37.31 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  36.5 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  39 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  38.37 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  39.37 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  37.89 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  38.31 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  39.36 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  39.74 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  41.04 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.03 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  40.15 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  40.15 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.49 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.31 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  37.84 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.15 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.75 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  38.4 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  39.83 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  36.19 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  38.67 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  39.06 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.17 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  38.71 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  42.11 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  38.28 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  40.32 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  36.58 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  40.79 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  39.22 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  40.8 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  38.16 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  38.89 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  40.87 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  39.66 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4997  Inositol-phosphate phosphatase  35.32 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000132366  normal  0.733856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  36.9 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.68 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  38.7 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>