18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5015 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  55.56 
 
 
467 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  42.09 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  35.68 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  31.06 
 
 
435 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  30.3 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
465 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  29.14 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  29.7 
 
 
485 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
470 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  30.5 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  24.44 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.75 
 
 
883 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  25.12 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 
883 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  21.59 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  22.97 
 
 
439 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>