18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3622 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 463 aa  926    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  50.97 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 		 465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  41.67 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  34.77 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  31.49 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  27.61 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  27.79 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  29.77 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  25.14 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  28.63 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  24.86 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  29.55 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  27.31 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  26.7 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  26.46 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.75 
 
 		 883 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>