18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1532 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  923    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  60.04 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  36.32 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  35.6 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  35.59 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  31.44 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  32.1 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  33.16 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  23.3 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  23.01 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  22.57 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  22.01 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.78 
 
 		 883 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  23.25 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  24.79 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  23.77 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>