18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4360 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  911    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  42.09 
 
 		 416 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  42.4 
 
 		 467 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  35.59 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  33.18 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  34.82 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  28.85 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  28.57 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 470 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 463 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  29.58 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  28.24 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  27.85 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  26.81 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  23.31 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  28.29 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.29 
 
 		 883 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>