18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0930 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  877    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  51.03 
 
 		 439 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  51.49 
 
 		 439 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  38.12 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.48 
 
 		 883 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  26.79 
 
 		 354 aa  93.6  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  27 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  26.11 
 
 		 485 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  24.93 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  23.76 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  23.42 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  23.5 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  22.6 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  23.31 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1751  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.9 
 
 		 972 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>