18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0679 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  98.16 
 
 
435 aa  893    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  906    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  30.3 
 
 
416 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  31.11 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  28.57 
 
 
452 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  25.17 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
465 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
463 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  23.3 
 
 
454 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  24.85 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  24.93 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  23.6 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  27.01 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  23.12 
 
 
485 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  26.73 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  26.56 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.45 
 
 
883 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>