18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4908 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  55.86 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  41.44 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  36.32 
 
 		 454 aa  243  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  35.77 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  35.68 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  33.18 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  34.51 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  32.54 
 
 		 467 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  25.17 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  24.94 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  25.54 
 
 		 393 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.46 
 
 		 883 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  29.62 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  27 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  28.93 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>