18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3202 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  980    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  60.04 
 
 		 454 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  35.77 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  34.82 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  31.35 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  31.05 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  30.96 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  23.12 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  22.29 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1517  hypothetical protein  20.9 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.16 
 
 		 883 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  26.33 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  26.87 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  26.24 
 
 		 439 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>