100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4100 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  100 
 
 
340 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  61.82 
 
 
349 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.7 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  61.59 
 
 
798 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  54.65 
 
 
345 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  54.35 
 
 
345 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  53.18 
 
 
327 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  53.14 
 
 
327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  51.11 
 
 
325 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  51.11 
 
 
325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.78 
 
 
352 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.91 
 
 
327 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.84 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  48.06 
 
 
1870 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  48.06 
 
 
1870 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  49.84 
 
 
320 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  45.83 
 
 
2997 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.84 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.65 
 
 
335 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.96 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.96 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.65 
 
 
339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.96 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  45.96 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.31 
 
 
343 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.75 
 
 
330 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.65 
 
 
336 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.84 
 
 
329 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  47.4 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  47.4 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  47.4 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  47.4 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  47.4 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  47.4 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  47.4 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  46.25 
 
 
340 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  45.11 
 
 
363 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.51 
 
 
344 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.45 
 
 
341 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.86 
 
 
332 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.12 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  43.17 
 
 
339 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  41.59 
 
 
3207 aa  275  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  41.93 
 
 
324 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  43.23 
 
 
3404 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.1 
 
 
337 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  40.78 
 
 
4502 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.13 
 
 
326 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  40.26 
 
 
3432 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  40.94 
 
 
353 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  36.25 
 
 
353 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  43.43 
 
 
326 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.64 
 
 
329 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  35.95 
 
 
353 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  35.95 
 
 
374 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  40.19 
 
 
362 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  37.66 
 
 
331 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  39.45 
 
 
362 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.39 
 
 
325 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  33.12 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  33.12 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  33.12 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  33.12 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  33.12 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.23 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.74 
 
 
357 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.94 
 
 
357 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.94 
 
 
357 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  32.34 
 
 
357 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  35.83 
 
 
355 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  35.83 
 
 
355 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  35.83 
 
 
355 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  35.83 
 
 
355 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  35.51 
 
 
355 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  35.51 
 
 
355 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  35.51 
 
 
355 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  31 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.9 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  30.4 
 
 
347 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  31.62 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.29 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  31.79 
 
 
329 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  27.22 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  25.24 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  29.85 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  24.92 
 
 
344 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  27.78 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  26.3 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  27.78 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  27.78 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  27.78 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  27.78 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  26.73 
 
 
363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  25.87 
 
 
435 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.63 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  21.33 
 
 
466 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  23.21 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>