99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1956 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  96.31 
 
 		 325 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  100 
 
 		 325 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  81.17 
 
 		 327 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  77.23 
 
 		 327 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  74.69 
 
 		 327 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  63.11 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  62.26 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  58.65 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  59.35 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  55.77 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  57.23 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  57.37 
 
 		 363 aa  362  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.42 
 
 		 343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.53 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  59.49 
 
 		 329 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.19 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.19 
 
 		 338 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  57.19 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.86 
 
 		 339 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  57.19 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.19 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.19 
 
 		 333 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.19 
 
 		 333 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.86 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  55.49 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  56.19 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.19 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.52 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.19 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  52.63 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  52.3 
 
 		 345 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.04 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  51.11 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  50.81 
 
 		 798 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  45.54 
 
 		 2997 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.63 
 
 		 352 aa  288  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  43.89 
 
 		 1870 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  43.79 
 
 		 1870 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  44.9 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  44.76 
 
 		 4502 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.58 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  46.23 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.68 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.85 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  41.37 
 
 		 3432 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  40.86 
 
 		 3404 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  47.35 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  40.75 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.19 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  39 
 
 		 3207 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  38.19 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  37.86 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  38.19 
 
 		 353 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.16 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  38.19 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.86 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  37.86 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  36.68 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  38.78 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.59 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  38.24 
 
 		 355 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  37.87 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  37.87 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  37.87 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  37.87 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  37.87 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  37.5 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.35 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.35 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.35 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.93 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  34.59 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  29.31 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  29 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.16 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  27.19 
 
 		 486 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  30.61 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  27.41 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  27.41 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  26.88 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  27.01 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  26.52 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.52 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.52 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  26.52 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  26.52 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  25.46 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  25.46 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  26.14 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 401 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  27.57 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.07 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  29.09 
 
 		 466 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>