100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3402 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
325 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.12 
 
 
349 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  40.14 
 
 
798 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  41.13 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  37.25 
 
 
3207 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.05 
 
 
337 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  38.06 
 
 
327 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.51 
 
 
327 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.24 
 
 
341 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.46 
 
 
335 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  37.86 
 
 
325 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  35.9 
 
 
374 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  35.58 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  39.61 
 
 
2997 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  35.26 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  35.58 
 
 
353 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  37.86 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.24 
 
 
344 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.75 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  38.6 
 
 
320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.85 
 
 
337 aa  215  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  36.39 
 
 
340 aa  215  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.81 
 
 
326 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  38.19 
 
 
1870 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  38.19 
 
 
1870 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.54 
 
 
345 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.54 
 
 
345 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.65 
 
 
352 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.53 
 
 
336 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  37.85 
 
 
340 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.74 
 
 
335 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  36.91 
 
 
324 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.74 
 
 
335 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  35.41 
 
 
335 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.27 
 
 
339 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.13 
 
 
329 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.92 
 
 
339 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.08 
 
 
335 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  36.02 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.46 
 
 
333 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.46 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.46 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.46 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  36.46 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.46 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  36.46 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  37.41 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.24 
 
 
330 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  36.56 
 
 
363 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.86 
 
 
328 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.79 
 
 
330 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  34.42 
 
 
4502 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.14 
 
 
357 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.14 
 
 
357 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.14 
 
 
357 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.22 
 
 
332 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
317 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
317 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
317 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
317 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  33.22 
 
 
362 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  33.33 
 
 
317 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
317 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  32.65 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.42 
 
 
357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  33.53 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  34.09 
 
 
3432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.31 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.22 
 
 
329 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  32.78 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  32.78 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  32.78 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  32.78 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  32.78 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.55 
 
 
3404 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  32.44 
 
 
355 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  32.44 
 
 
355 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  32.33 
 
 
486 aa  169  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  32.25 
 
 
326 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  27.6 
 
 
347 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  29.02 
 
 
347 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.83 
 
 
335 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  28.77 
 
 
329 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  26.03 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  27.27 
 
 
359 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  27.27 
 
 
341 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  27.27 
 
 
341 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  27.27 
 
 
341 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  27.27 
 
 
359 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  26.73 
 
 
344 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  27.59 
 
 
344 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  27.08 
 
 
464 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  24.29 
 
 
363 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  24.43 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  25.45 
 
 
366 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  23.46 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  25.82 
 
 
466 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.42 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.35 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>