98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9638 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  100 
 
 		 326 aa  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.09 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.77 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.32 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.27 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  45.22 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  41.39 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  41.78 
 
 		 798 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.3 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.45 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  40.56 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.02 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  42.12 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.32 
 
 		 332 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.05 
 
 		 326 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  43.43 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  41.41 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  40.75 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.72 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.41 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.94 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  41.84 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  41.84 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  41.84 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  41.84 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  41.84 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  41.84 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.44 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.44 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.11 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.11 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  41.49 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.8 
 
 		 335 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  37.81 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.02 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.1 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.28 
 
 		 329 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.18 
 
 		 330 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.94 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  39.36 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.74 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  37.55 
 
 		 1870 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  37.55 
 
 		 1870 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  40.59 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  39.21 
 
 		 362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.59 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  37.86 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  37.86 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  37.5 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  35.84 
 
 		 3432 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  35.41 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  35.51 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  35.51 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  35.51 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  35.51 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  35.51 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.13 
 
 		 4502 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 		 2997 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  36.33 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  34.28 
 
 		 353 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.21 
 
 		 3404 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 		 3207 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.25 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.03 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.03 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.03 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.68 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  33.68 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  34.06 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  34.06 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  34.06 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  34.06 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  34.06 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  34.06 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  34.06 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.13 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.91 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  27.91 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  27.57 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  28.17 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  24.19 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  24.19 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  26.37 
 
 		 359 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.37 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  26.37 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.37 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  26.37 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  26.01 
 
 		 464 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  24.15 
 
 		 366 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  23.97 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  25.23 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  24.31 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  22.38 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  24.91 
 
 		 466 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>