82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44770 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  100 
 
 
466 aa  972    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  34.85 
 
 
435 aa  232  9e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.45 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.71 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.73 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  24.29 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.3 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  25.23 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.14 
 
 
345 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.6 
 
 
337 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  23.13 
 
 
329 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  24.92 
 
 
347 aa  64.3  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.14 
 
 
345 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.91 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.04 
 
 
343 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  30.17 
 
 
333 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  29.49 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.97 
 
 
326 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  27.47 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  29.91 
 
 
363 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  29.74 
 
 
333 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  29.74 
 
 
338 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  29.74 
 
 
338 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  29.74 
 
 
338 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  29.74 
 
 
333 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  29.74 
 
 
338 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  21.33 
 
 
340 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.22 
 
 
339 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  25.95 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  24.91 
 
 
3207 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  23.05 
 
 
486 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.58 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.22 
 
 
339 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.58 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.58 
 
 
335 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.3 
 
 
336 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.3 
 
 
335 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.82 
 
 
325 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  25.76 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.76 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.76 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.28 
 
 
329 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  25.76 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.76 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.48 
 
 
326 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.14 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.01 
 
 
349 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.28 
 
 
352 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.81 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.1 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.1 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.1 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  24.76 
 
 
798 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  26.47 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.27 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  26.27 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.49 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.27 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  26.27 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.27 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.05 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  26.27 
 
 
355 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  31.96 
 
 
341 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  31.96 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  31.96 
 
 
341 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  23.13 
 
 
327 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  31.96 
 
 
341 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  31.96 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25 
 
 
328 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  31.96 
 
 
464 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  32.65 
 
 
362 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  23.13 
 
 
1870 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  24.91 
 
 
326 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  23.13 
 
 
1870 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.84 
 
 
327 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  24.05 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  25 
 
 
4502 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  29.7 
 
 
320 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  23.18 
 
 
353 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  23.18 
 
 
374 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>